Revisar las tecnologías de secuenciación de próxima generación como un punto de inflexión en la investigación, el diagnóstico y el tratamiento de enfermedades raras

Curr Med Chem. 2018 30 de enero; 25 (3): 404-432. doi: 10.2174 / 0929867324666170718101946

Fernández-Marmiesse A 1 , Gouveia S 1 , Couce ML 1 .

Información del autor

1

Unidad de Diagnóstico y Tratamiento de Enfermedades Metabólicas Congénitas, Departamento de Pediatría, Hospital Clínico Universitario de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, España.

Abstracto

Aproximadamente 25-50 millones de estadounidenses, 30 millones de europeos y el 8% de la población australiana tienen una enfermedad rara. Por lo tanto, las enfermedades raras son un problema común para los médicos y representan enormes costos de atención médica en todo el mundo debido a la dificultad de establecer un diagnóstico específico. En este artículo, revisamos los hitos logrados en nuestra comprensión de las enfermedades raras desde el surgimiento de las tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS) y analizamos cómo estos avances han influido en la investigación y el diagnóstico. La primera mitad de esta revisión describe cómo NGS ha cambiado los flujos de trabajo de diagnóstico y ha proporcionado una forma simple y sin precedentes de descubrir nuevos genes asociados a la enfermedad. Nos enfocamos particularmente en los trastornos metabólicos y del neurodesarrollo. NGS ha permitido el diagnóstico genético barato y rápido, destacó la relevancia del mosaico y las mutaciones de novo, sacó a la luz el amplio espectro fenotípico de la mayoría de los genes, detectó la herencia digenética o la presencia de más de una enfermedad rara en el mismo paciente, y pavimentó el forma de nuevas terapias prometedoras. En la segunda parte de la revisión, observamos las limitaciones y desafíos de NGS, incluida la determinación de la causalidad variante, la pérdida de variantes en regiones codificantes y no codificantes, y la detección de variantes de mosaico somático y mutaciones epigenéticas, y discutimos cómo estos se pueden superar en el futuro cercano.

PALABRAS CLAVE:

Secuenciación de próxima generación; diagnóstico; herencia digenica; exome; genoma; enfermedades raras; investigación

PMID: 

28721829 

PMCID: 

PMC5815091 

DOI: 

10.2174 / 0929867324666170718101946

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28721829?dopt=Abstract