Inmunodeficiencia primaria: eficacia clínica de un panel de genes de secuenciación de próxima generación

Clin Genet. 2018 Mar; 93 (3): 647-655. doi: 10.1111 / cge.13163. Epub 2018 2 de febrero

Rae W 1, 2 , Ward D 3 , Mattocks C 3 , Pengelly RJ 4 , Eren E 1 , Patel SV 5 , Faust SN 2, 4, 5 , Hunt D 6 , Williams AP 1, 3, 4 .

Información del autor

1

Departamento de Inmunología, University Hospital Southampton NHSFT, Southampton, Reino Unido.

2

Institución de investigación clínica del Instituto Nacional de Investigaciones Sanitarias de Southampton, Hospital Universitario Southampton NHSFT, Southampton, Reino Unido.

3

Laboratorio Hub Wessex Investigational Sciences, Hospital Universitario Southampton NHSFT, Southampton, Reino Unido.

4

Facultad de Medicina, Universidad de Southampton, Southampton, Reino Unido.

5

Inmunología pediátrica y enfermedades infecciosas, Children's Hospital Southampton, Southampton, Reino Unido.

6

Servicio de Genética Clínica Wessex, Hospital Universitario Southampton NHSFT, Southampton, Reino Unido.

Abstracto

Las inmunodeficiencias primarias (PID, por sus siglas en inglés) son raros errores monogénicos congénitos de la inmunidad que producen un deterioro de las funciones del sistema inmunitario humano. Los PID tienen un amplio fenotipo con mayor morbilidad y mortalidad, y las opciones de tratamiento a menudo son complejas. Con un mayor acceso a la secuenciación de próxima generación (NGS), la tasa de descubrimiento de las causas genéticas para PID ha aumentado exponencialmente. La identificación de un diagnóstico monogénico subyacente proporciona beneficios clínicos importantes para los pacientes con el potencial de alterar los tratamientos, facilitar el asesoramiento genético y el diagnóstico previo a la implantación. Investigamos un panel NGS PID de 242 genes dentro de la atención clínica en un rango de fenotipos PID. También evaluamos el Phenomizer para predecir genes causales a partir de términos de ontología del fenotipo humano (HPO). Veintisiete participantes fueron reclutados, y se identificaron un total de 15 variantes notificables en el 48% (13/27) de los participantes. Los resultados del panel tuvieron implicaciones para el tratamiento en el 37% (10/27) de los participantes. Phenomizer identificó los genes que albergan variantes de los términos HPO en el 33% (9/27) de los participantes. Este estudio muestra la eficacia clínica que las pruebas genéticas tienen en el cuidado de la EPI. Sin embargo, también destaca algunas de las desventajas de los paneles de genes en el campo de la genómica de PID que se mueve rápidamente y los desafíos actuales en la asignación de términos de HPO para PID.

PALABRAS CLAVE:

diagnóstico clínico; ontología de fenotipo humano; secuenciación de próxima generación; inmunodeficiencia primaria

PMID: 

29077208 

DOI: 

10.1111 / cge.13163

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29077208?dopt=Abstract